V pražské kvalifikaci se sešla silná konkurence, mezi čtveřicí účastníků se objevil vítěz Superligy 2012 BS Ladronka a další dva účastníci této soutěže – Beach Polabí Přerov nad Labem a Braník BS. Čtveřici doplnil nadějný celek BFC Malá Strana. Vítězem kvalifikace se stala domácí Ladronka, kterou v cestě do finále Českého poháru nesastavila ani porážka s Braníkem. Ten totiž zaváhal s Polabím, byť do zápasu lépe vstoupil Braník a vedl po první třetině 2:0. Polabí dokázalo vyrovnat a nakonec se radovalo z vítězství díky lépe zvládnutému penaltovému rozstřelu.
Výsledky:
BS Ladronka – Beach Polabí Přerov nad Labem 4:2 (1:0, 3:2, 0:0)
Gastrosun Braník BS – BFC Malá Strana 4:1 (2:0, 0:1, 2:0)
BS Ladronka – BFC Malá Strana 3:1 (0:0, 0:0, 3:1)
Beach Polabí Přerov nad Labem – Gastrosun Braník BS 2:2 (0:2, 1:0, 1:0) 1:0 pen.
BFC Malá Strana – Beach Polabí Přerov nad Labem 2:1 (0:0, 0:0, 2:1)
BS Ladronka – Gastrosun Braník BS 1:1 (0:0, 1:1, 0:0) 0:1 pen.
Tabulka:
1. BS Ladronka 2 1 0 8:4 6
2. Gastrosun Braník BS 1 2 0 7:4 5
3. BFC Malá Strana 1 0 2 4:8 3
4. Beach Polabí Přerov nad Labem 0 1 2 5:8 2
